Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms