Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd1P13516 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd1P13516 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scd1P13516 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scd1P13516 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scd1P13516 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scd1P13516 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scd1P13516 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scd1P13516 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd1P13516 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd1P13516 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd1P13516 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd1P13516 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd1P13516 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd1P13516 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd1P13516 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd1P13516 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms