Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms