Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Becn2P0DM65 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms