Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sbk3P0C5K0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbk3P0C5K0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms