Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefmP08553 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefmP08553 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NefmP08553 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefmP08553 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefmP08553 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefmP08553 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefmP08553 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefmP08553 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefmP08553 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefmP08553 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefmP08553 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefmP08553 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefmP08553 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefmP08553 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefmP08553 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefmP08553 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefmP08553 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NefmP08553 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefmP08553 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NefmP08553 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefmP08553 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefmP08553 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefmP08553 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefmP08553 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefmP08553 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefmP08553 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefmP08553 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms