Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Prm2P07978 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Prm2P07978 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms