Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtrP07309 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtrP07309 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtrP07309 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtrP07309 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
TtrP07309 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtrP07309 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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TtrP07309 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TtrP07309 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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TtrP07309 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TtrP07309 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TtrP07309 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TtrP07309 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TtrP07309 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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