Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa4P06798 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms