Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-Eb1P04230 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms