Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Dnmt3bO88509 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Dnmt3bO88509 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Dnmt3bO88509 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Dnmt3bO88509 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Dnmt3bO88509 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Dnmt3bO88509 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Dnmt3bO88509 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnmt3bO88509 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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