Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnmt3aO88508 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms