Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CntfrO88507 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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