Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nme6O88425 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nme6O88425 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme6O88425 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme6O88425 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme6O88425 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms