Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AvilO88398 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AvilO88398 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AvilO88398 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms