Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col5a1O88207 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col5a1O88207 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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