Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nptx2O70340 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms