Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrna4O70174 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrna4O70174 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms