Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AurkbO70126 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms