Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChkbO55229 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChkbO55229 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChkbO55229 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms