Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ldb2O55203 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ldb2O55203 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ldb2O55203 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ldb2O55203 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ldb2O55203 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ldb2O55203 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ldb2O55203 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldb2O55203 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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