Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pja1O55176 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pja1O55176 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pja1O55176 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja1O55176 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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