Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Lgals6O54891 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Lgals6O54891 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms