Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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CrxO54751 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxO54751 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxO54751 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxO54751 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxO54751 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxO54751 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CrxO54751 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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CrxO54751 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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CrxO54751 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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CrxO54751 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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CrxO54751 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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CrxO54751 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CrxO54751 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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CrxO54751 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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CrxO54751 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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CrxO54751 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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CrxO54751 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CrxO54751 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CrxO54751 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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