Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bnc1O35914 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms