Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pik3cdO35904 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pik3cdO35904 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms