Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1mwO35599 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Opn1mwO35599 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Opn1mwO35599 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Opn1mwO35599 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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