Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Clk4O35493 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Clk4O35493 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk4O35493 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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