Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk2O35491 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk2O35491 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms