Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Edil3O35474 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms