Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kpna6O35345 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms