Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kpna4O35343 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms