Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra2O08842 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms