Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eftud2O08810 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms