Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20939L7N243 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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