Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm379J3QQ19 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm379J3QQ19 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm379J3QQ19 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm379J3QQ19 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm379J3QQ19 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm379J3QQ19 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm379J3QQ19 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm379J3QQ19 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm379J3QQ19 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm379J3QQ19 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm379J3QQ19 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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