Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm21797J3QNW5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm21797J3QNW5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gm21797J3QNW5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm21797J3QNW5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm21797J3QNW5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm21797J3QNW5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm21797J3QNW5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Gm21797J3QNW5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm21797J3QNW5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm21797J3QNW5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm21797J3QNW5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21797J3QNW5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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