Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms