Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21060J3KMU4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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