Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pabpc4lG5E8X2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms