Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm5624F6ZZG8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5624F6ZZG8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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