Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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