Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20671F6TVX7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20671F6TVX7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20671F6TVX7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20671F6TVX7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20671F6TVX7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20671F6TVX7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20671F6TVX7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20671F6TVX7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20671F6TVX7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20671F6TVX7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms