Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms