Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC005561E9Q5E2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC005561E9Q5E2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms