Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C2cd2E9Q3C1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C2cd2E9Q3C1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms