Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc171E9Q1U1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc171E9Q1U1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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