Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrp3E9Q1T6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms