Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt78E9Q0F0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms