Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms